E' capitato anche a me, e mi è sembrato collegato al messaggio che avvisa della ricezione di nuovi MP: se all'accesso compare questo messaggio perché si hanno degli MP, dopo non vengono più segnalati i
nuovi messaggi. Per risolvere l'ho disattivato da Pannello di controllo -> Modifica le opzioni -> Visualizza un nuovo messaggio privato in una finestra.
Così, per quanto mi riguarda, non succede più ma non so se è lo stesso vostro problema.